Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn18P56857 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn18P56857 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn18P56857 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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