Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrpP56473 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrpP56473 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrpP56473 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrpP56473 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms