Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtskP55097 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtskP55097 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtskP55097 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtskP55097 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtskP55097 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms