Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RabggtbP53612 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RabggtbP53612 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms