Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Map3k1P53349 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Map3k1P53349 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Map3k1P53349 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms