Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx1P52955 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lbx1P52955 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms