Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms