Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apobec1P51908 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms