Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn1cP49919 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn1cP49919 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms