Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod1P49813 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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Tmod1P49813 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod1P49813 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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