Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcls1P49710 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms