Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Epb42P49222 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epb42P49222 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epb42P49222 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms