Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnni3P48787 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnni3P48787 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms