Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptx3P48759 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms