Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VdrP48281 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VdrP48281 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VdrP48281 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VdrP48281 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms