Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RpiaP47968 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RpiaP47968 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms