Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms