Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnr1P47746 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms