Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms