Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ItgavP43406 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms