Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtgfrP43117 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtgfrP43117 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms