Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syt4P40749 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms