Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rfc1P35601 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms