Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RetP35546 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RetP35546 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RetP35546 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RetP35546 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RetP35546 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RetP35546 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RetP35546 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RetP35546 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RetP35546 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RetP35546 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RetP35546 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RetP35546 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RetP35546 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RetP35546 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RetP35546 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms