Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab20P35295 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab20P35295 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms