Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sftpa1P35242 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms