Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptk2P34152 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptk2P34152 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms