Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifnar1P33896 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifnar1P33896 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms