Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrkcdP28867 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcdP28867 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms