Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprmP28828 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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