Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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