Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apex1P28352 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms