Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa2P28309 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms