Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb1P28230 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms