Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms