Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms