Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CftrP26361 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CftrP26361 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CftrP26361 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CftrP26361 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CftrP26361 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CftrP26361 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CftrP26361 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CftrP26361 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CftrP26361 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CftrP26361 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CftrP26361 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CftrP26361 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms