Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms