Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms