Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZfaP23607 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms