Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gja1P23242 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms