Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PparaP23204 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PparaP23204 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PparaP23204 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PparaP23204 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PparaP23204 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms