Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SftpcP21841 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms