Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bmp4P21275 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bmp4P21275 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms