Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ms4a2P20490 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms