Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcaP20444 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcaP20444 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcaP20444 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcaP20444 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcaP20444 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms