Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfaP20033 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms