Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Esr1P19785 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms