Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lama1P19137 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lama1P19137 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lama1P19137 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama1P19137 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama1P19137 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms