Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RargP18911 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RargP18911 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RargP18911 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RargP18911 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RargP18911 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RargP18911 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms